- Đoàn khoa Toán – Tin học
- Đoàn khoa Công nghệ thông tin
- Đoàn khoa Điện tử – Viễn thông
- Đoàn khoa Hoá học
- Đoàn khoa Sinh học – Công nghệ Sinh học
- Đoàn khoa Vật lý – Vật lý Kỹ thuật
- Đoàn khoa Môi trường
- Đoàn khoa Địa chất
- Đoàn khoa Khoa học liên ngành
- Đoàn khoa Khoa học và Công nghệ vật liệu
- LCH khoa Toán – Tin học
- LCH khoa Công nghệ thông tin
- LCH khoa Điện tử – Viễn thông
- LCH khoa Hoá học
- LCH khoa Sinh học – Công nghệ Sinh học
- LCH khoa Vật lý – Vật lý Kỹ thuật
- LCH khoa Môi trường
- LCH khoa Địa chất
- LCH khoa Khoa học liên ngành
- LCH khoa Khoa học và Công nghệ vật liệu
- CLB Lý luận trẻ
- CLB Sách
- CLB Tuyên truyền viên
- CLB Ong nghiên cứu
- CLB Anh văn BEE
- CLB MICUS
- Đội Văn nghệ Xung kích
- Đội Công tác Xã hội
- CLB Thể thao điện tử
- CLB Sinh viên 5 Tốt
- CLB Kỹ năng
- CLB Chữa lành
- CLB TEDxHCMUS
- CLB Khởi nghiệp – Đổi mới – Sáng tạo Khoa học
- Ban Truyền thông MAT